MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16B

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021525	CTT	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
2	NC_021525	CTTG	2	8	1570	1577	0 %	50 %	25 %	25 %	513844789
3	NC_021525	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
4	NC_021525	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	513844789
5	NC_021525	CTGTT	2	10	1683	1692	0 %	60 %	20 %	20 %	513844789
6	NC_021525	TCTT	2	8	1768	1775	0 %	75 %	0 %	25 %	513844789
7	NC_021525	T	7	7	1833	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
8	NC_021525	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
9	NC_021525	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
10	NC_021525	TCT	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
11	NC_021525	ACT	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844789
12	NC_021525	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844789
13	NC_021525	AAACA	2	10	2169	2178	80 %	0 %	0 %	20 %	513844789
14	NC_021525	A	6	6	2178	2183	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
15	NC_021525	CAT	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844789
16	NC_021525	T	6	6	2234	2239	0 %	100 %	0 %	0 %	513844789
17	NC_021525	A	7	7	2369	2375	100 %	0 %	0 %	0 %	513844789
18	NC_021525	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844789
19	NC_021525	TATG	2	8	5383	5390	25 %	50 %	25 %	0 %	513844790
20	NC_021525	CAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
21	NC_021525	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844790
22	NC_021525	TGT	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
23	NC_021525	AAT	2	6	5633	5638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844790
24	NC_021525	TAC	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844790
25	NC_021525	GCT	3	9	5706	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
26	NC_021525	A	7	7	5726	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	513844790
27	NC_021525	TTG	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
28	NC_021525	GTTT	2	8	5804	5811	0 %	75 %	25 %	0 %	513844790
29	NC_021525	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844790
30	NC_021525	CAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
31	NC_021525	CAGT	2	8	5946	5953	25 %	25 %	25 %	25 %	513844790
32	NC_021525	TTA	2	6	5984	5989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
33	NC_021525	ATT	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
34	NC_021525	CCT	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513844790
35	NC_021525	CTG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
36	NC_021525	TTA	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
37	NC_021525	GCT	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
38	NC_021525	AGC	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844790
39	NC_021525	GAA	2	6	6450	6455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844790
40	NC_021525	AGCA	2	8	6468	6475	50 %	0 %	25 %	25 %	513844790
41	NC_021525	GTTGAT	2	12	6555	6566	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	513844790
42	NC_021525	AGT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844790
43	NC_021525	TAT	2	6	6623	6628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
44	NC_021525	TTG	2	6	6709	6714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844790
45	NC_021525	TCT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
46	NC_021525	TCAAT	2	10	6779	6788	40 %	40 %	0 %	20 %	513844790
47	NC_021525	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
48	NC_021525	CAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
49	NC_021525	AGA	2	6	6920	6925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844790
50	NC_021525	CTG	2	6	6967	6972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844790
51	NC_021525	AAC	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
52	NC_021525	TTC	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
53	NC_021525	AAAG	2	8	7092	7099	75 %	0 %	25 %	0 %	513844790
54	NC_021525	TAC	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844790
55	NC_021525	CA	3	6	7150	7155	50 %	0 %	0 %	50 %	513844790
56	NC_021525	CTT	2	6	7162	7167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
57	NC_021525	AGA	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844790
58	NC_021525	A	6	6	7278	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	513844790
59	NC_021525	TAA	2	6	7322	7327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844790
60	NC_021525	GGAAG	2	10	7338	7347	40 %	0 %	60 %	0 %	513844790
61	NC_021525	AAC	2	6	7401	7406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844790
62	NC_021525	ATT	2	6	7422	7427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
63	NC_021525	TTA	2	6	7433	7438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844790
64	NC_021525	TGA	3	9	7490	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844790
65	NC_021525	GGT	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844790
66	NC_021525	CTT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844790
67	NC_021525	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844790

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.